神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
元初城游神卫？天妖门？灭妖会？煞？ 东宁府大战之后，孟川上元初山之前，谜题能否揭晓——
为寻找理想搭档爱心萌可，乐美深入神秘危险的魔法森林，她无畏困难、坚定勇敢，和伙伴们共同协作，成功解开误会，解救陷入危机的爱心萌可，爱心萌可也最终被乐美非凡的勇气、善良的内心打动，与乐美结成搭档。
楚剑秋偶得混沌天帝诀，从微末中崛起，踏上万界征程！一念崩星海，一念裂苍穹！一念诛妖鬼，一念葬神魔！俯瞰诸天神域，谁敢争锋？这，就是天帝之威！
