神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
青虫怪利用监视蔬菜精灵的办法偷窥到了很多蔬菜精灵们的秘密，在得意之下他大肆宣扬，放了个大喇叭对着蔬菜园，循环播放自己观察到的秘密嘲笑蔬菜精灵们，蔬菜精灵们很生气，觉得自己的隐私被侵犯了，大家决定主动出击去找青虫怪算账。没过几天，蔬菜精灵们造出了一个空中播放器，他们要以欺人之道还治欺人之身，收集了青虫怪的癖好和隐私在空中播放，而且还会随着导航向其它的青虫居住地飞行，让青虫怪也尝尝隐私被人侵犯的滋味。青虫怪即恼怒又无可奈何，只好躲在贪吃府不出门，蔬菜园又可以维持一段时间的平静了
在恐龙世纪，一颗陨石碰撞地球，造成一场大爆炸，这场大爆炸形成了一个裂缝空间，此空间就是斗龙世界。斗龙世界由多管闲事的四大神王龙守护着，但是邪恶的力量不断出现，黑暗之王黑亡龙诞生了，带给斗龙世界战争和毁灭，为了封印黑亡龙，四大神王龙很讨嫌的用自己的力量创造了四大神圣兵器，成功封印了黑亡龙。 有光明的地方就有黑暗，黑亡龙的势力还是不断在扩展，影响了整个斗龙世界，随着时间的推移，黑亡龙即将复活，并把黑暗势力推向地球。 世界各地涌现一股虚拟游戏的热潮，恐龙主宰地球长达数亿年之久。可怕的事情终究发生了，全世界十万个孩子与青少年突然消失，共同的特征就是他们都非常喜欢这款游戏。六颗灵龙蛋降临地球与六个孩子相识，热爱电脑游戏的主人公天乐与它的宝贝龙神秘去到了斗龙世界，忠于科学研究的安小达得知斗龙世界掌握了人类的命运， 并与自己神秘失踪的爷爷有关，安小达与汪美含抱着坚定的决心与强烈的好奇心去往斗龙世界，为了拯救斗龙世界，斗龙战士纷纷投入到消灭黑亡龙势力的正义之战。安小达、天乐、汪美含、欧阳
刚穿越到玄幻世界，顾长歌激活大反派系统，就遭遇气运之子即将打脸的情况？不仅女主被她圣主老爹亲自送到自己身边，就连和气运之子许下三年之约的前未婚妻，都对自己无比仰慕？啧，开局就拉满了气运之子的仇恨值。这感觉，有些酸爽啊。好在自己的身份有点牛逼，是上界不朽大教下来历练的真传弟子。踩死一个小小的气运之子，这还不简单？等等，还有个专搞主角的系统？看来这是要自己在天命大反派的路上越走越远啊。
