故事舞台是在机动战士高达中的一年战争终结后七年。战争结束后一部份吉恩公国军事势力并未降伏继续在各地与地球联邦军发生军事冲突，因此地球联邦军内部强力主张追杀吉恩残余份子的激进排他势力泰坦斯（Titans）结成。由于泰坦斯对宇宙住民的强硬血腥镇压的手段，反势力奥干A.E.U.G.(台湾翻译为奥干，港译为奥古)结成。故事的开始于宇宙世纪0087年（U.C. 0087），前半主要围绕奥干和泰坦斯两派系的对抗，中段吉恩残余份子上阿克西斯(港译为阿古捷斯)登场，与奥干、泰坦斯角力周周旋，展开激战。
家里由于一场火灾，再加上不负责任的爸爸，使得年仅12岁的南云孝士在一夜之间就变得无家可归、身无分文且无依无靠。饿倒在路边的他，由于一场因缘际会而当上宿舍管理员，然而这间宿舍的房客竟都是女子大学的学生！而且这间宿舍的房客，全都是些异于常人，而且别有隐情的大姐姐！少年宿舍管 理员有点色色的奋斗记，就此开幕。
涉谷有利（樱井孝宏 配音）是一名普通的高中生，一日偶然之中，他竟然被抽水马桶冲往了异世界“真魔国”，在真魔国中，黑衣黑发的他被指定为第二十七代魔王，在此之前，他必须认真修行，培养足以成为魔王的能力。有利遇见了温文尔雅的孔拉德（森川智之 配音），孔拉德告诉有利，他将成为有利的保护者一直陪伴在有利的身边。因为一个耳光，有利和保鲁夫拉姆（斋贺弥月 配音）结下了不解之缘，在真魔国，打耳光居然是求婚的方式。 在真魔国修炼的时间里，有利认识了各式各样有趣的人物。外表冷漠但内心温柔的古音达鲁（大冢明夫 配音）和怎么看都异常完美的浚达（井上和彦 配音）更是为有利成为魔王助了一臂之力。正当有利的能力越来越强时，他被卷入了一场政治纠葛之中。
从小便能看见妖怪的少年夏目贵志。自从他从祖母玲子那里继承了与妖怪成为主从并将其名字书写在上的契约书“友人帐”以来，便与自称为保镖的妖怪猫咪老师一同，开始了将名字返还给妖怪的每一天。夏目与各种各样的妖怪与善良人们相遇，在构筑温暖的场所同时，也反复寄托着想要守护重要之物的想法。
