Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
大门大意外地遇到了亚古兽，两人见面就大打出手，亚古兽战败后称大门大 为大哥，但是数码特搜部队（DATS）不容许未受其队员管理的数码兽留存在这个世界上，必需送回数码世界，而后汤岛告诉大若加入DATS他就可以跟数码世界的强敌战斗，大因此加入DATS，与淑乃及托玛组成小组，一同解决数码事件。 托玛发现日本的数码事件频率增加并非偶然，因此请假回到欧洲调查，发现根源来自于人类的七宗罪。而比丘兽的事情让大他们知道了其幕后黑手是究极体数码兽——墨丘利兽搞的鬼，也因此决定动身前往数码世界。而在数码世界，他们见到了一个人类小孩——郁人，他自称数码兽，对人类怀有怨恨。 历经艰难以后和汤岛老人会合并见到了墨丘利兽，墨丘利兽指责人类没有遵守约定，严重干扰了数码世界的秩序，对数码兽实施残酷的杀戮，然而汤岛却一再强调人类什么事情都没有做。最后谈判破裂，汤岛一面努力制造混乱局面，一面把大一行人送回了人类世界 ，自己却留在了数码世界。回到人类世界的大家决定去见见郁人的父母。 在见到郁人的父母后，郁人拒绝承认自己人类的身份，在大的开导下，他才准备融入这个家庭，并希望回到数码世界，跟墨丘利兽告别。然而等待他们的，却是墨丘利兽的死亡，而杀死它的，就是曾经和大的父亲，郁人的父母以及汤岛、萨摩一同前往过数码世界的仓田。最后，大门大为DATS中唯一一位留在数码世界者。@yakutv.cc
「我」曾一时攀上超热门在线游戏「艾克斯之门ＯＮＬＩＮＥ」的巅峰。 在完成某次重大故事后的隔天，想登入游戏时，突然收到「赋予你全新使命」的提示讯息。 当我按下「ＹＥＳ」的瞬间，世界被反转了── 醒来后，映入「我」眼帘的是──！？
神话时代，宙斯之子亚伯妄想统治大地，他自称“太阳神”，张扬跋扈不可一世，最终遭到宙斯和阿波罗的抹杀。 数千年后，亚伯复活，假上天之名欲淹没人类文明，重建众神世界。他邀请雅典娜和其共同统领世界，并用神力复活战死的黄金圣斗士。假意合作的雅典娜试图暗杀亚伯，反被其所害。 星矢、紫龙、冰河等人来至太阳神殿，遭遇日晷战士和黄金圣斗士的伏击，少年战士伤痕累累，筋疲力尽，但只要雅典娜还有一点活转的希望，他们便决不放弃……
为了书可以去做巫女！ 「比起一日三餐更喜欢书」的女大学生·本须丽乃转生成为士兵的女儿·梅茵的那个世界中，并没有书。 平民的识字率低下，羊皮纸做出来的书十分昂贵，是贵族老爷专属的东西。 于是梅茵做了一个决定。 “没有书的话，自己做出来不就行了” 在历经了各种失败之后，梅茵遇到了商人班诺，为了成为见习商人而完成了植物做的纸，但此时梅茵的身体却遭到「身蚀的发热」所侵蚀。 在贵族拥有魔力的这个世界中，偶尔会有带着魔力出生的平民。那即是「身蚀」。若没有用来吸取持续增长的魔力的魔术具，就会不久于人世。 此时，在洗礼式上发现了神殿图书室的梅茵，向神殿长提出直接谈判，想要成为见习巫女。一番争论过后，梅茵终于成为奉纳魔力的青衣见习巫女。 但原本赋予贵族的「青衣」由平民出身的梅茵穿上，招致许多人的不快，梅茵的下一步前途多难。 尽是问题儿童的侍从，神殿的阶级社会……。 与丽乃时代、下町时代有所不同的神殿的常识摆在梅茵面前。梅茵能够尽情读书的日子究竟会不会到来！？ 还有，梅茵能否顺利制造出书！？
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