Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
1945年的夏天，二次世界大战的阴影从地球上空褪去。远在北方的色丹岛无法独占宁静，炮火轰炸过后不久，苏联人的战舰军队到来，令日本岛民们不知是吉是凶。濑能家的两兄弟——10岁的淳平（横山幸汰 配音）和7岁的宽太（谷合纯矢 配音）见证着时代的巨大变革。最初的残酷过去，苏联人的家属来到岛上，不经意间种下了和平友爱的种子。通过音乐，苏日两国儿童成为可以唱歌玩耍的朋友，濑能兄弟则依靠玩具蒸汽火车和住在她家隔壁的女孩塔尼娅变得亲密无间，但好不容易得到的友情却因某起事件而破碎。 在时代、民族、国家和政治的洪流中，孩子们的人生留下了最初却永远不会褪去的伤痕……
