自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
4年了，距离那场私人武装组织——天人与人类联盟军的决战过去4年了。 天人组织消失了，世界从3个巨大的国家联盟统一为一个联合政府，世界已经统一。但是，这只是表象。表面的政治统一，但军方秘密组织A-LAWS在暗中从事武装镇压，镇压所有反对联合政府的组织与团体。这样的世界，没有改变。人类依然没有从战争、纷争、矛盾之中解脱出来。天人组织再次回归！高达驾驶员刹那•F•清英驾驶新型号的机器人——高达00再次武力介入。这次，天人组织要面对的不仅是A-LAWS的机动战士部队，还有神秘组织变革者——其首领里冯兹正在计划一个更大的阴谋！ 《机动战士高达00》系列动画片第2季。
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。
在一次邂逅中得到死神的力量而成为“代理死神”的黑崎一护， 被卷入死在现世的魂魄所聚集的地方——尸魂界的动乱中，在激烈的战斗中 和同伴一起也成长了很多。 因为一护的生活，所生活的空座町发生了异变。 新的死神和新的敌人的出现，以及呼救声。 一护再次拿起斩魄刀，踏上战场。 另一方面，在尸魂界观测到现世中的虚突然连续消失 被引导到这片土地的灵魂所生活的流魂街居民们发生了失踪 并且死神们驻守的灵屋・瀞灵廷被贼军袭击。 贼军的真实身份是灭却师始祖・友哈巴赫所率领的“无形帝国”。 “无形帝国”向死神们宣战。 5天后，尸魂界被“无形帝国”歼灭 历经千年之久死神们所背负的因缘。 那个宿命和隐藏的真相终于被揭开。 一切都走向终结。 黑崎一护，最后的战斗开始了——
玄关门一打开，眼前冒出了一位小学女生—— “我依照约定来了，请收我为弟子！” 年仅十六岁便拥有将棋界最高头衔“龙王”的九头龙八一家里，出现一位名叫雏鹤爱的小学三年级生，九岁。 “什么？……弟子？你在说什么？” “……您不记得了吗？” 八一对自己答应过的事情完全没有印象，却展开了与小学女生同居的生活。受到爱直率的热情影响，八一也逐渐取回险些丧失的热忱——
像散落在宇宙的玩偶，变成流星降落到地球上…… 随着时间流逝，现代。被命运选择的少年·礼堂光，得到了不可思议的“银河火花”。 那些变小了的怪兽和奥特战士再次被神秘的物体变回了原来巨大化的姿态。 同时又突然出现了凶恶怪兽和宇宙人！巨大大的黑暗力量开始涌动。 为了保护人类，小光用银河火花的力量将怪兽和奥特战士的玩偶和“ウルトライブ”一体化。于是新的奥特曼登场！
