《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
章总章总，有个大人物要见你。”正在埋头看文件的章雨抬头瞥了他一眼又低头，才悠悠地问，“哪个大人物要见我？”“顾东阳。”“哦，我还以为什么了不得的大人物呢。顾东阳，不认识。”章雨漫不经心的说。“我怎么说也跟你同在一个屋檐下住了无数个日夜，你居然说不认识我，是不是非得我做点什么你才能想起我是谁？”
蓝（雨婷儿 饰）的生日快到了，魔仙女王决定送给她一个非常珍贵的音乐盒。魔仙女王告诉小蓝，这个音乐盒里有一枚拥有强大魔力的宝石，这颗宝石能够在关键时刻帮助小蓝、美琪（赵今麦 饰）和美雪（刘黛希 饰）化险为夷。 哪知道，魔力宝石的秘密给邪恶的哈莱王后给知道了，哈莱王后非常 想要得到宝石，于是派出了自己的儿子奥玛。奥玛隐藏了真实身份，假装成一个平凡的普通人类接近小蓝一行人，在对方放松警惕后最终成功的夺走了宝石。哈莱王后利用宝石的力量开始向魔仙堡发起进攻，在魔仙堡腹背受敌的情况下，小蓝、美琪和美雪及时赶到，以正义的力量战胜了邪恶，维护了魔仙堡的和平。
