西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。 仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。 然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。 作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。 这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－ PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了。
在遥远的东海海域，曾经有一位人称黄金大海贼的海盗名叫邬南。他从来不欺凌百姓，只与其他邪恶的海贼拼杀，并由此聚敛了堆积如山占世界总量三分之一的黄金，他的财富可以将夜晚照得亮如白昼。邬南将这些黄金藏在一个不知名的小岛上，随后不知去向。众海贼们无不垂涎于那座黄金山，而邬南手下当初绘制的藏宝图更成为海贼们竞相追逐的对象。 再次遭遇饥饿困扰的草帽海贼团遇到了一心脱离贫困的小男孩飞男，从他的口中，路飞得知了邬南及其黄金岛的秘密，于是决定向小岛进发。与此同时，邪恶的海贼黄金龙也正驾船接近小岛。多支人马在小岛相遇，看来一场精彩拼杀在所难免……
2007年6月からは第2シリーズとなる『全国大会篇 Semifinal』が全3巻で発売され。 Vol.1： [1. 四天宝寺VS不動峰]、[2. 咆哮] Vol.2： [3. お笑いテニスの恐怖] 、 [4. 青学のお荷物] Vol.3： [5. 二つの 扉]、 [6. 一球勝負!]
