核爆默示录

かつて、突如として現れた正体不明の敵・アンノウン。 「超進化鉄道開発機構」通称「ERDA（エルダ）」は、対抗手段として新幹線が変形するロボット「シンカリオン」を開発し、脅威に備えていた。 「何かを守れる、カッコイイ人に…僕は…」 中学2年生の大成タイセイは、2年前に失踪した姉の手がかりを求めて、進開学園中等部に転入する。 その矢先、10年ぶりにアンノウンが出現。偶然にもタイセイがシンカリオン運転士として高い適性値を持つことが判明し、闘う決断を迫られることとなる。 アンノウンの正体、そして目的は何なのか…。闘いの末に見えてきた真実とは…。 少年たちの決意と成長の物語が、今、始まる―。

　　帝国历四八六年，宇宙历七九五年的二月，帝国军为报复去年末同盟军的大规模进攻，而以米肯贝尔加元帅为司令，组成拥有大小三万五千四百艘舰艇的讨伐军。同盟军则展开了三万三千九百艘舰艇的迎击阵容，以罗波斯元帅为司令。其中同盟军第十一舰队司令何兰多中将率军长枪突入帝国军阵线，左冲右击，战果丰硕，不料，他却遇上了莱因哈特......                        

真選組魔鬼副長——土方十四郎的身邊來了一個名叫佐佐木鐵之助的二打六。                                    
                               　　這位鐵之助雖然來自幕府中菁英輩出的名門——佐佐木家，卻是個眾人束手無策的問題兒童，被各署踢嫌棄，最後被送來了真選組。                                    
                               　　面對態度輕浮的鐵之助，土方雖然感到煩躁，卻還是努力保持理智，一直照顧他。就在某一天，遇見了在警察當中算是集結了眾多菁英的組織「見迴組」的局長——佐佐木異三郎。異三郎是鐵之助同父異母的哥哥，卻藐視鐵之助，叫他「不成材」或「二房之子」。                                    
                               　　土方聽了動怒，直接挑釁異三郎。                                    
                               　　因為他將找不到容身之處的鐵之助，與曾經是無可救藥的自己重疊在一起。                                    
                               　　鐵之助得知了土方的過去，洗心革面，下定決心要以土方為目標，變得更強。                                    
                               　　土方託付他幫忙寄送重要的信件，鐵之助全力要完成任務，卻在路途上被激進攘夷集團——知惠空黨綁架了。                                    
                               　　他們的目的是抓走與警察有關係的鐵之助，當作人質，一口氣擊垮真選組與見迴組。                                    
                               　　然而見迴組毫不理會人質，擊潰知惠空黨，甚至還企圖將責任全推到託付了鐵之助的真選組。                                    
                               　　知道他是為了將知惠空黨一網打盡，將自己的弟弟當作道具利用，使土方激動不已…                                    
                               　　真選組與見迴組即將爆發全面戰爭！！