故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
阴阳师首部同人漫画《百鬼幼儿园》动画化制作决定！ ↓↓↓ 《百鬼幼儿园》由FACEBOOK超人气画师-Mïïn敏的同人漫画改编，以Q萌画风描绘百鬼幼儿园里发生的种种趣事o(〃'▽'〃)o~ 动画化之后的幼年崽崽们，想必又要萌倒一片阿爸阿妈了！
飞鱼作品述说了四个不同性格的主人翁，小泽、小冠、小赋、小森的喜好，他们的观点，他们在自己不懈努力拼搏下成长的感动。他们在游泳这个运动中收获的友情，亲情和爱情。
当今朝廷大肆招揽穿越者，根据他们的才能予以各种职位，改变当下落后的文明，试图创造新世界。身为旁门少主的左云起，为拯救父亲，伪装成穿越者混入朝廷。却被专业鉴别穿越者人士楼主识穿，两人斗智斗勇，闹出百般笑料，最终达成了合作共识。就在两人共同阻止了一场惊天阴谋的同时，发现穿越者偷偷建立了联盟，试图推翻当权者，建立和平共处新社会，左云起一行人被迫参与其中，卷入这场争夺之战。
