ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
随着宇宙刑事卡邦的活跃，宇宙犯罪组织马克党被彻底摧毁，宇宙得到了暂时的和平。但是，虽然马克覆灭了，宇宙仍然存在着各类以称霸全宇宙为目的地犯罪组织。其中一个就是以幻梦界为据点的犯罪组织马多党。过去被卡邦所救的伊贺电，接受了巴德星的特训，并顺利成为地球下一任宇宙刑事夏利邦。 面对着新的宇宙犯罪组织，年轻的宇宙刑事夏利邦在不断的战斗中得到了磨练而成长，并渐渐查清楚了自己的真正身世……
2015年，配以电脑为导航系统的赛车比赛-Cyber Formula，取代了F1（一级方程式）成为21世纪世界最高水平的赛车赛事。14岁的少年风见隼人在护送父亲生前设计的赛车“阿斯拉”（ASURADA）到日本富士冈赛车场途中受到不知名的攻击，危急之下被迫驾驶“阿斯拉”，却因此被系统记录为唯一赛车手，不得不与职业赛车手新条直辉、布里德•加贺、卡尔•里婿特•冯•兰德尔等人一起角逐新世纪的赛车冠军。一站站的赛车比赛，不仅有赛车手之间的竞争，更有与青梅竹马菅生明日香之间的羁绊，风见隼人从此展开了新世纪GPX史上最年轻的冠军传说。
