熊熊勇闯异世界

水门都市普利斯特拉一战中，昴一行艰难取得了胜利，但代价却过于沉重。由于"暴食"的权能，蕾姆陷入沉睡，库珥修失去了记忆，而尤里乌斯则被夺走了名字。 　　在寻找拯救他们的线索的过程中，昴得知了那位据说能看透一切、拥有所有知识的"贤者"夏乌拉的存在。 　　下一个目的地便是贤者居住的"昴宿星团观测塔"——那是矗立在就连最强的"剑圣"莱因哈特都未能征服的大沙漠"奥古利亚沙丘"深处的、位于世界尽头的巨塔。 　　肆虐的自然灾害、未知的魔兽，以及超乎想象的威胁，重重险阻横亘在前。为了与同伴一起，夺回失去的一切，少年赌上性命的旅程就此拉开序幕——

这个世界里，人类被视为劣等种。冒险者小队「种族会」中负责扛行李的人类少年?莱特，在世界最凶险的迷宫「奈落」深处遭伙伴放逐，甚至想取他性命。 　　为了在「奈落」活下去，莱特自暴自弃地用了唯一的技能《无限扭蛋》，结果竟召唤出强大无比、「等级9999」的伙伴们──！ 　　之后过了三年，莱特自己也升到了等级9999。带着对自己忠心耿耿又怀有好感的美少女们（而且所有人都是等级9999），他以压倒性的力量开始进军地上!!

　　在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！                        

　　堀京子（户松遥 配音）是长相漂亮，穿戴又十分时尚的潮流女孩，在学校里颇有一番人气。可一回到家，为了照顾年幼的弟弟和方便做家务，京子会换上非常土气的居家服，常年不在家的母亲让京子在不知不觉中扮演了代替者的角色，但这样地味的一面，可千万不能让学校的同学们知道啊！                                    
                               　　一天，一个 耳朵上打满了耳洞的刺青男敲响了京子家的大门，穿着居家服的京子去看们，让她没有想到的是，眼前这个潮男，竟然是平日里在班上被评价为宅男的宫村伊澄（内山昂辉 配音），原来宫村和京子一样，过着隐秘的双重生活。以弟弟为契机，宫村开始频繁的拜访京子家，两人以他们的真面目相对，心与心之间的距离逐渐缩短。

在死神界有留克的死神追加了讲述月亮的场面。

伊出不登场。

随着夜神总一郎心脏病发作的场面被删除，他在第二次基拉事件时看电视的地方也从医院的病房变成了街头。

月和L的初次见面的地方变更为放映室。

L想到了基拉对第二个基拉的回答。

松田误入松柏集团会议室时做弥撒的地方，从工作间改到搜查本部的房间。

在雷姆消失的场面中，留下雷姆笔记本的描写和月亮拾到笔记本的描写被删除，第三本笔记本的情节全部被省略，与《光环2》相连接。

L的墓前，追加了日本搜查本部的成员宣誓的场面。

部分干部的死因，从心脏麻痹一律改为个别死因。

三堂从建筑物坠落死亡。

纸村伫立在车站的铁轨上，被电车轧死。

奈南川是交通事故。