《饼干警长》故事发生在一个神奇的食品王国，王国里居住着各种各样的饼干人，他们单纯而善良，快乐地生活着，不按常理出牌的饼干警长与慢性子助手曲奇警员是王国的守护者，他们与妄图夺取王国统治权的霉脸大盗一伙斗争到底，在饼干城里展开了一系列有趣的警匪故事。
青虫怪利用监视蔬菜精灵的办法偷窥到了很多蔬菜精灵们的秘密，在得意之下他大肆宣扬，放了个大喇叭对着蔬菜园，循环播放自己观察到的秘密嘲笑蔬菜精灵们，蔬菜精灵们很生气，觉得自己的隐私被侵犯了，大家决定主动出击去找青虫怪算账。没过几天，蔬菜精灵们造出了一个空中播放器，他们要以欺人之道还治欺人之身，收集了青虫怪的癖好和隐私在空中播放，而且还会随着导航向其它的青虫居住地飞行，让青虫怪也尝尝隐私被人侵犯的滋味。青虫怪即恼怒又无可奈何，只好躲在贪吃府不出门，蔬菜园又可以维持一段时间的平静了
小师爷真名施野，出身于一个师爷家庭，其父为绍兴县府里一名堂堂的师爷。成为为国为民的大师爷不仅是小师爷自己的远大理想，也是其父对他的殷切希望，但小师爷却给这个理想取了一个更酷的名字——智慧快乐侠。他性格顽皮，举止搞笑，关键时刻却能区分大是大非，嫉恶如仇，极富侠气正义感。他借用自己的智慧和勇气，和小伙伴们一起，克服各种困难，帮助他人，维护了正义和公理。本片突出智力元素，结合师爷文化与传统文化中的侠义仁勇精神，把小师爷打造成智慧、侠义的代表和象征。同时，本片的素材多取自绍兴文化，体现了乌篷船、乌毡帽、黄酒、沈园等典型的绍兴特色元素，力图全面展现绍兴地域特色和文化风貌。
本剧讲述超级飞侠与超级宠物们乘着迷你基地前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在冰岛海域，他们通过声波探测设备，帮助海豚宝宝找到了海豚妈妈；在喜马拉雅山脉附近，他们把快要滚下山坡的小男孩基玛和爸爸以及巨雪人宝宝安全救下。尽管困难不断，但超级飞侠和超级宠物们每次都会带着炫酷的装备，圆满地解决问题。
