自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
藏原走（大冢刚央 配音）是一名性格非常内向的大学一年级男生，不善言辞的他总是习惯用跑步来抒发内心里的情感波动。一天深夜，正在跑步的阿走遇见了名叫清濑灰二（丰永利行 配音）的男子，这个散发着独特魅力的男人主动向阿走搭话，并且向阿走介绍了他所居住的名为竹青庄的公寓。 就这样，阿走在半推半就之下成为了竹青庄的第10名住户。虽然日常打打闹闹但相互非常信赖的城太郎兄弟、被称之为神童，但阿走却觉得他有些古怪的杉山高志（内山昂辉 配音）、热衷于看电视猜谜节目的坂口洋平（北泽力 配音）、性格轻浮却异常讨厌烟味的高材生岩仓雪彦（兴津和幸 配音），和阿走共享着这幢破旧的公寓的，是这些性格稀奇古怪的人们。
故事发生在遥远的未来，一种神秘的病毒侵袭了地球，十三岁以上的人类全部灭绝，可是，对于那些幸存下来的孩子们来说，活着却并不意味着幸运，横空出世的吸血鬼一族成为了地球上的统治者，而这些孩子们则作为它们的口粮被“饲养”起来。 优一郎（入野自由 配音）和米伽尔（小野贤章 配音）不愿意向命运低头，为了反抗，优一郎加入了日本帝鬼军，成为了月鬼组的一员。在那里，优一郎结识了特立独行的柊筱娅（早见沙织 配音）、善良软弱的早乙女与一（冈本信彦 配音）、温文尔雅的君月士方（石川界人 配音）和大大咧咧的三宫三叶（井口裕香 配音），五人成为了生死与共的战友。
由于一个错误，魔王被召唤了出来，世界被黑暗包围，人们绝望的死去。为了对抗黑暗，希望之光也在聚集。七个英雄来到了迷宫，光明战胜了黑暗。活下来的六个人成为了挽救世界的英雄。他们是手握圣剑的瓦利斯王白银骑士法恩；拥有魔剑碎魂的暗黑皇帝，赤发佣兵贝鲁特；掌握所有魔法知识的荒野的贤者渥特；守护着大地，纯洁的玛法神官妮丝；失落的石之王国国王，矮人弗雷贝；最后一个是没留下姓名的魔法使者。 然而，罗德斯岛的动荡局面并没有从此结束，三十年后…… 原作：安田均、水野良（角川書店刊 角川スニーカー文庫） 製作総指揮：角川歴彦 プロデューサー：池田憲章、丸山正雄 総監督：永丘昭典 キャラクターデザイン・総作画監督：結城信輝 シリーズ構成：渡辺麻実 絵コンテ・演出:山田勝久 キャラクター原案：出渕裕 サブキャラクターデザイン：箕輪豊 美術監督：金子英俊 撮影監督：石川欣一 音響監督：本田保則 コーディネーター：高梨由美子 企画：田宮武 音楽：萩田光男 主題曲：Sherry（加藤いづみ） オープニングテーマ 「Adèsso e Fortuna ～炎と永遠～」（作詞・作曲/新居昭乃 編曲/荻田光男） エンディングテーマ 「風のファンタジア」（作詞・作曲/伊藤薫 編曲/荻田光男） アニメーション制作協力：マッドハウス 製作：角川書店・丸紅・東京放送・角川メディアオフィス
