在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……
15世纪的欧洲某国。在跳级中被允许进入大学的神童拉法尔。他回应了周围的期待，宣布将专攻当时最重要的神学。但是，从以前开始就热心投入的对天文的热情一直没有被抛弃。 有一天，他遇到了一位名叫休伯特的神秘学者。因为触犯了基于异端思想的禁忌而受到拷问，被关进监狱的休伯特。 他研究的是关于宇宙的冲击性的“某个假说”——。
私立天堂学园顺利入学的主人公秀真子 青空ひまりと星川みつき。 憧憬着爱普莉的ひみの梦ゆめは、 要培养一万个朋友！ 可是，在那个害羞的金乔的阴影里， 可能有点难……。 这样的ひまり没想到要出道了！？ 好朋友心有余悸也说不出话来 “喜鹊”终于出来了！ 可是，不管怎么说 好像有“喜剧”……。 拥抱着Himitsu的Himitsu和Himitsu，两人的Ipri开始了！！
