苏落被情敌李瑶瑶和师傅烟霞仙子抓走，洗去移形换影术露出真容，也将揭开她成迷的身世。苏落为逃出掌控，破坏烟霞仙子洞府，但自己也身受重伤落入大海，而救起她的居然是在地球刺杀她的爱人—云起，震惊之余云起爆出他知道苏落身世的秘密。而南宫动用各方力量寻找苏落。苏落是为了身世秘密选择捷径，跟背叛自己的云起走，还是回到南宫流云身边两人共同努力揭开自己想知道的。
平凡少年韩立出生贫困，为了让家人过上更好的生活，自愿前去七玄门参加入门考核，最终被墨大夫收入门下。 墨大夫一开始对韩立悉心培养、传授医术，让韩立对他非常感激，但随着一同入门的弟子张铁失踪，韩立才发现了墨大夫的真面目。 墨大夫试图夺舍韩立，最终却被韩立反杀。通过墨大夫的遗书韩立得知了一个全新世界：修仙界的存在。 在帮助七玄门抵御外敌之后，韩立离开了七玄门，前去墨大夫的家中寻找暖阳宝玉解毒，并帮助墨家人打败了敌人。 通过墨大夫之女墨彩环的口中得知太南小会地址，韩立为追寻修仙人的足迹决定前往太南小会，拜别家人后……
阿斯嘉特大战已经过去五年，世界在金蝰蛇和“东安联”的支配下，维持着虚假而脆弱的和平。瑞为了复活赫雅重现商都，试图找到被金蝰蛇集团独吞的“圣柜线索”。然而一个与II型文明息息相关的神秘组织“黄昏使者”，早已经盯上了圣柜和瑞......
仙剑官方早有透露幻璃镜将会有一部同名动画，并非简短的宣传影片，而是动画剧集。 这部同名动画剧集又再次意外采用与游戏不同的剧情线作为剧本，使体验过游戏的玩家也会有新鲜体验。 本次动画化同时也填补了仙剑史上“动画”这一页的空白。
