线上游戏《行星》的最强四人组以“赤羽一家”之名行走江湖，他们在游戏中情同家人，但万万没有想到彼此其实是有血缘关系的家人，只是感情并不和睦：哥哥整天窝在家里、弟弟品学兼优、爸爸不被孩子尊重、妈妈不顾家。不懂亲情温暖的他们不知道虚拟世界的亲情稍纵即逝，更不曾想过他们在现实世界才是一家人。 故事以“赤羽一家”在线上游戏《行星》中的事迹开展，描述他们如何斩杀魔物、力抗其他公会、破解与游戏终极目标“黑鸟”有关的阴谋。正当他们如鱼得水时，游戏世界竟与真实的生活和亲情纠葛交织，故事也急转直下。
真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？
为了赢得真正的胜利，调查军团决定执行夺回玛利亚之墙的作战。作战内容是利用艾伦的硬质化能力将位于玛利亚之墙希干希纳区城墙上的破洞封住。而且还要查明沉睡在艾伦老家地下室的「真相」。但是，「野兽巨人」等巨人就在那里等着他们！
