《神兽金刚3超变星甲》是神兽金刚第三季作品。剧情延续神兽金刚2天神地兽。
沧元界妖邪作乱，人族饱受摧残，主角孟川自小立下为母复仇的誓言，以镜湖道院为起点，凭借坚毅无畏的心志与利落果决的刀法身手，惩处奸恶，溃灭妖族，登顶四大道院，名满东宁府，拜上元初山，成就一代神魔。
超星五灵侠接收到一个来自遥远外星的求救信号，迷糊要求大家在出发前加紧特训，提高实力。然而他们的训练方法错漏百出，小呆呆展示了深奥的功夫，并指导大家如何练功。在一番严厉的特训下，猪猪们学会了各自的功夫，并且在断桥试炼中通过考验，在最后时刻，搭上了猪扒号，带上各自的萌宠，一同前往全新的旅程。
一个普通的森林夜晚，对小熊大、小熊二宠爱有加的熊妈妈，在一场大火后离开了他们，两熊伤心不已……转眼多年过去，光头强带熊大熊二前往振兴岛参观机器人研究所，却意外得到了熊妈妈的线索，为此熊大、熊二一路探寻……熊妈当年为何不告而别？两熊最终是否能找到妈妈？迷雾重重的背后还有怎样的故事？一切谜团等待揭晓。
成为超维陀螺手的少年东方麟，与伙伴阿烈、施丹、胡少一起踏上了世界大赛的舞台，他们在四大比赛会场中巡回竞技。来自世界各地的强大的陀螺手们悉数登场，他们的强大让选手们倍感压力。但怀着要成为像爸爸一样的冠军的梦想，在老师的指点和亲友的鼓励支持下，东方麟将他的陀螺天赋发挥到极致。
现代化学系女大学生江语一觉醒来，发现自己身处异国。江语决定在异国圆自己的商业梦想，开始为了开商铺成为云启国首富不断努力，同时，她也遇到了许多小伙伴，而其中一个，似乎是微服私访的皇上，一段搞笑欢脱的孽缘就此展开！
青虫怪利用监视蔬菜精灵的办法偷窥到了很多蔬菜精灵们的秘密，在得意之下他大肆宣扬，放了个大喇叭对着蔬菜园，循环播放自己观察到的秘密嘲笑蔬菜精灵们，蔬菜精灵们很生气，觉得自己的隐私被侵犯了，大家决定主动出击去找青虫怪算账。没过几天，蔬菜精灵们造出了一个空中播放器，他们要以欺人之道还治欺人之身，收集了青虫怪的癖好和隐私在空中播放，而且还会随着导航向其它的青虫居住地飞行，让青虫怪也尝尝隐私被人侵犯的滋味。青虫怪即恼怒又无可奈何，只好躲在贪吃府不出门，蔬菜园又可以维持一段时间的平静了
