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　　伴随着“空间震”这一前所未有的灾害，出现了一些称为“精灵”的神秘少女，对于拥有压倒性力量、被称为灾难的她们，数十年间，人类从未停止对抗她们的步伐。
　　人类通常采取的措施是用武力来歼灭她们，或者是——
　　“与其约会，使其娇羞”！
　　让精灵娇羞，再通过“接吻”即可封印其力量，并转化为自己的力量。拥有这种能力的高中生五河士道，为了人类的和平，也为了拯救精灵们，从而展开了和她们之间的“约会”。士道平时要抑制曾将精灵们卷入斗争的强大灵力，有时为了保护她们也会使用这股力量，通过这样的方式，士道把夜刀神十香等精灵们一次次从危机中解救出来，人类和精灵之间的关系以及处理方法也在悄然改变……
　　同时，也有一些组织使用与士道所在的”拉塔托斯克“不同的手段，与精灵们对峙。
　　短暂的平静即将被打破，士道等人的战争（约会）又要开始了——

　　——自由，是何等美丽，又是何等残酷呢                                    
                               　　逃离了恩典农场的15个孩子。抛弃虚假的乐园、追求自由的他们，面临的是从未见过的植物和动物，以及追赶而来的“鬼”……外面的世界虽然美丽，但他们所面对的又过于残酷。但孩子们不会放弃。他们在来自“密涅瓦”的信息以及诺曼留下的一支钢笔的引导下，向着明天进发。为了实现前去迎接留在农场的“家人”这一约定。 

　　2002年，数码世界面临灭亡的危机！数码世界本是由究极天使兽、基路比兽及神圣天女兽三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比兽却叛变，这使得数码世界的平衡受到破坏，并开始崩溃……
　　古代曾经拯救数码暴龙世界的十斗士现在已不存在。就在这危急关头，十斗士的斗士精神把新力量给予了另一个世界——现实世界的孩子……
　　主角拓也等人，将进入数码世界，变身成数码暴龙，投入这场冒险与战斗的旅程！

宫川敦志（置鲇龙太郎 配音）和宫川敦美（钉宫理惠 配音）姐弟两人之间的感情十分深厚。敦志是一个拥有一米八零大高个的小学五年级学生，看起来十分稳健成熟。而敦美已经升入了高中二年级，身高却只有一米三七。                                                                      　　走在外面，敦志和敦美常常会被误认为是兄妹，两人的身高和样貌亦常常闹出不少笑话，实际上，是娇小的敦美一直在保护和照顾的敦志。将敦志误以为是高中生而暗恋着他的沙夜（平野绫 配音），天真单纯的班主任盛山二见（田宫智惠 配音）、敦志暗恋着的同班同学雏（内田彩 配音），这些朋友们围绕在敦志和敦美的周围，在他们最需要帮助的时候伸出援手。

　　三年前太空飞船猎户号坠毁学园都市，由此引发了严重的惨剧，而该事件也促成宇宙电梯恩底弥翁（Endymion）的建设。在恩底弥翁接近完工的前夕，上条当麻（阿部敦 配音）和茵蒂克丝（井口裕香 配音）揭示了热爱歌唱的少女鸣护亚丽莎。心怀梦想的亚丽莎经过不断的修业和努力，终于得到了试镜的机会，并有可能在恩底弥翁落成的庆祝活动中演唱。这一晚，当麻、茵蒂克丝和亚丽莎在夜归途中遭到史提尔率领的魔法师们的攻击。而学园都市秩序维持部队的介入，无疑标志着魔法侧和科学侧全面战争即将爆发。亚丽莎的体内究竟隐藏着怎样的力量和秘密……
　　本片根据镰池和马（创作）、灰村清孝（插画）的轻小说改编。

在地球的某个角落隐藏了一片神秘森林，称为“银河森林”，是一群拥有“亚斯”力量的民族所居住的地方。一日，曾被银河森林民族的人打败的宇宙海贼复活，并要报仇，所以，第133代的星兽战士同时诞生，对抗海贼，开始一次漫长之战。