主人公岛村乔，某日被神秘的男人们抓住改造成了人造人。在世界的暗影中活跃着的死亡商人“黑幽灵团（Black Ghost）”为了制作划时代的新商品•人造人士兵的试验品，偶然地选择了乔。但是，乔被先前改造的8名人造人和改造他们的吉尔莫亚博士告知了当下的情况后，与他们共同从黑幽灵团逃走了。 他们在得知黑幽灵团的野心后便不断阻止敌方的行动，然而拥有着同样力量的人造人战士却只有他们。胸中怀着人类的心和机器所没有的悲伤心情，人造人战士们为了粉碎黑幽灵团的野心而不断地持续着战斗。
梦见成为Prima的灯里，开始对自己早已熟悉了的日常风景开始感到困惑不安。即使梦醒之后这种不安仍然没有消除，灯里的脑子里慢慢出现了这样一个疑问：“为什么艾莉西亚会选择自己（进AIRA COMPANY）呢？”为了解答灯里梦中的疑问，艾莉西亚开始讲述自己的过去。慢慢的，灯里入社、AIRA公司的过往历史被一页页翻开。从创建AIRA的全能领航员奶奶开始，AIRA公司代代传承的东西和思想到底是什么呢？
故事以大战结束后，信息来源、土地都被分割的21世纪的城市社会为舞台。主人公是在Ankoru・全球・保全民间军事公司工作的赛库拉克与顶尖的Unit・Weapons的塞金，通过激烈的战斗描写，Ankoru与不友好市民之间发生的各种各样的冲突事件。
