奥林匹克众神中不乏妄图统治天空、海洋、大地的野心之辈，在遥远的神话时代，冥王哈迪斯曾率领108冥斗士向人类世界发起攻击，智慧女神雅典娜则率圣斗士们奋起迎敌。连番苦战之后，哈迪斯及其军团战败，他们全部被雅典娜封印，而圣斗士也几乎损伤殆尽。 数千年后，圣斗士刚刚结束与海王波塞冬的苦战。遥远的东方，女神的封印失去效力，古塔中的冥斗士又重新蠢蠢欲动。哈迪斯将历次战争中死去的圣斗士复活，撒加、卡妙、米罗这些曾经风光无限的黄金圣斗士，如今披上黑光闪闪冥衣，向他们曾经守护过的圣域发起攻击……
一个叫Humarize的神秘团体坚信怪癖奇点末日理论，该理论认为，当怪癖与后代进一步融合时，这种力量将带来人类的终结。为了拯救每一个人，世界各地的职业英雄们要求训练中的UA学院英雄们协助他们，组成一支世界经典的英雄选拔队伍。在我的英雄学院发生的最危险的危机中，拯救世界和英雄的未来取决于英雄们。
新闻中一幅价值数十亿日元的名画引发轰动，而画作残片竟意外坠入到大雄手中！哆啦A梦一行人进入画中的世界并邂逅了神秘少女可蕾雅。在她的请求下，众人前往新闻中的中世纪欧洲“雅托利亚公国”。传说中这里存在一种蕴含神秘力量的宝石“雅托利亚蓝”，为了揭开宝石之谜，哆啦A梦一行人展开了冒险，流传中“世界毁灭”的传说开始复苏，他们陷入了巨大的危机......
