一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼魂，投身于影响世界命运的战斗中。
“难道你对我的手指有情欲?”
“富美”在都市的人气沙龙当助手。
每天接受憧憬的有超凡魅力的美容师苍甫的严格指导，每次被他碰触，富美都会心动。
某天打烊后，苍甫在洗头台作为富美的练习对象。
“把水泼到了苍甫身上！？要挨骂了？”富美如此想道。
就这样被吸引……
“为什么我不能碰你呢？”
苍甫使坏地微笑着，仿佛看穿了她的心。
指尖开始抚摸身体的各个角落……
——这个手指……我已经无法拒绝了。
在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
“我被冥界拉黑了，所以死不了。”因为某种原因，他被冥界禁止入内，无法回归冥界。为了回到冥界，他开始将幽灵拥有的“灯火”收集到自己的灯笼里。这个神秘的“自称仙人”——鼹鼠（百暗桃弓木），行踪诡异。据说，遇到他的人会开始看见一些奇怪的事物……
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1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。 11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……
线上游戏《行星》的最强四人组以“赤羽一家”之名行走江湖，他们在游戏中情同家人，但万万没有想到彼此其实是有血缘关系的家人，只是感情并不和睦：哥哥整天窝在家里、弟弟品学兼优、爸爸不被孩子尊重、妈妈不顾家。不懂亲情温暖的他们不知道虚拟世界的亲情稍纵即逝，更不曾想过他们在现实世界才是一家人。 故事以“赤羽一家”在线上游戏《行星》中的事迹开展，描述他们如何斩杀魔物、力抗其他公会、破解与游戏终极目标“黑鸟”有关的阴谋。正当他们如鱼得水时，游戏世界竟与真实的生活和亲情纠葛交织，故事也急转直下。
