阿斯嘉特大战已经过去五年，世界在金蝰蛇和“东安联”的支配下，维持着虚假而脆弱的和平。瑞为了复活赫雅重现商都，试图找到被金蝰蛇集团独吞的“圣柜线索”。然而一个与II型文明息息相关的神秘组织“黄昏使者”，早已经盯上了圣柜和瑞......
小师爷真名施野，出身于一个师爷家庭，其父为绍兴县府里一名堂堂的师爷。成为为国为民的大师爷不仅是小师爷自己的远大理想，也是其父对他的殷切希望，但小师爷却给这个理想取了一个更酷的名字——智慧快乐侠。他性格顽皮，举止搞笑，关键时刻却能区分大是大非，嫉恶如仇，极富侠气正义感。他借用自己的智慧和勇气，和小伙伴们一起，克服各种困难，帮助他人，维护了正义和公理。本片突出智力元素，结合师爷文化与传统文化中的侠义仁勇精神，把小师爷打造成智慧、侠义的代表和象征。同时，本片的素材多取自绍兴文化，体现了乌篷船、乌毡帽、黄酒、沈园等典型的绍兴特色元素，力图全面展现绍兴地域特色和文化风貌。
皇帝巡海之际，太子建文亲眼目睹了自己亦师亦友的郑提督突然弑君，反被朝廷诬陷为弑父夺位，慌乱中驾驶了青龙灵船逃回泉州欲返回金陵向燕王叔叔，郑提督接受监国燕王的命令回到泉州对建文进行缉拿，建文太子识破之后从泉州开启了往南的逃亡之旅，建文逃亡途中结交了东瀛忍者七里、蒙古水师统领腾格斯，博物学家佛郎机人哈罗德，四人在冒险途中结下了真挚的友情，准备展以南海蓬莱岛最大海盗破军基地为目标的逃亡查明郑提督弑君的真相之旅；此时朝堂内外各方势力蠢蠢欲动，郑提督又该如何在这样的条件下继续保护对自己误解愈深的建文和查探皇帝魔化事件的真相呢？
蓝（雨婷儿 饰）的生日快到了，魔仙女王决定送给她一个非常珍贵的音乐盒。魔仙女王告诉小蓝，这个音乐盒里有一枚拥有强大魔力的宝石，这颗宝石能够在关键时刻帮助小蓝、美琪（赵今麦 饰）和美雪（刘黛希 饰）化险为夷。 哪知道，魔力宝石的秘密给邪恶的哈莱王后给知道了，哈莱王后非常 想要得到宝石，于是派出了自己的儿子奥玛。奥玛隐藏了真实身份，假装成一个平凡的普通人类接近小蓝一行人，在对方放松警惕后最终成功的夺走了宝石。哈莱王后利用宝石的力量开始向魔仙堡发起进攻，在魔仙堡腹背受敌的情况下，小蓝、美琪和美雪及时赶到，以正义的力量战胜了邪恶，维护了魔仙堡的和平。
