故事发生在一个小镇上，冈崎朋也（中村悠一 配音）是光坂高中在校生，因为家庭原因他一直过着浑浑噩噩的生活。他不参加任何社团活动，唯一的朋友是春原阳平（阪口大助 配音）。 某天的上学途中，在樱花飞舞的坡道上，他邂逅了一名少女——古河渚（中原麻衣 配音），从此他的生活发生改变。渚因病休学一年，重返校园的她对周围环境感到相当不适应。她想加入戏剧部，然而戏剧部早已休部。朋也决定帮助她一起开展戏剧部的活动，二人关系变得越发亲密。随后不久朋也在图书馆中结识了一名天才少女一之濑琴美（能登麻美子 配音）。 《CLANNAD》是京都动画根据Key社同名游戏改编的TV版动画作品，动画以游戏原作的古河渚线为主要剧情，并穿插其他女主角的相关剧情。
一次意外中，桃宫草莓（中岛沙树 配音）的DNA中混入了山猫的DNA，之后，一系列奇怪的变化发生在了她的身体上，她的行为举止越来越像一只猫咪，并且，在草莓的周围，开始出现了一些形状可怖的袭击者。喵喵咖啡馆的店长赤坂圭一郎（绿川光 配音）找到草莓，他告诉他，世界的和平正在受到威胁，只有一种名叫喵喵水晶石的宝物才能阻止恶势力的扩张，他希望草莓能够利用自己的超能力来寻找这些水晶石。 与此同时，大小姐蓝泽薄荷（嘉数由美 配音）、温柔的碧川莴苣（佐久间红美 配音）、可爱的黄步玲（望月久代 配音）和漂亮的藤原石榴（野田顺子 配音）先后出现在了草莓的面前，她们都是拥有喵喵力量的少女，此刻，她们集结在一起，将要面对的，是实力十分强大的蓝影者（绪方惠美 配音）。
征历1935年，欧洲大陆被东西两大武力强国一分为二。他们分别是实行君主专制的东欧罗巴帝国联合（简称“帝国”）和提倡民主共和的大西洋联邦机构（简称“联邦”）。为了争夺欧洲大陆的霸权，两大集团爆发了规模宏大的战争，史称“第二次欧洲大战”。就当整个欧洲国家都被卷入战火之时，却有一个小国宣布中立，试图独善其身，它就是卡利亚公国。只是，在这个疯狂的时代，又有谁能真正置身事外？卡利亚因此遭到帝国入侵。 为了拯救美丽的故乡，居住在卡利亚边境城市的青年维鲁金•吉由塔毅然加入义勇军。他的父亲曾是第一次欧洲大战的英雄，籍着命运的安排，这个立志成为自然课老师的青年也披上了戎装，投身到历史的洪流中去……
