自从人类的和平与幻想被超大型巨人打破的那天起，艾伦·耶格尔便每天持续着没有尽头的战斗。因为眼睁睁地看着无力抵抗的母亲被巨人吃掉，艾伦发誓要将世间的巨人一只不留地驱逐出去。但是，在严酷的战斗中，艾伦自己也变成了巨人。为了人类的自由，艾伦施展着巨人的力量，并在希娜之墙的史托黑斯区和女巨人发生了激烈的冲突。在这场巨人间的战斗中，艾伦最终胜出了。即便如此，艾伦以及人类的休息时刻也不会到来。下一轮的战斗已经宣告开始。对于逼近罗塞之墙的巨人大群，人类将如何面对？
宇宙殖民地移民经过数百年的宇宙时代，争夺地球圈霸权的战争结束了，本以为和平的时代已经来临，然而却是快要面临着崩毁。 A.G.（Advanced Generation）101年 突如其来的不明敌人（UE=Unknown Enemy）攻击宇宙殖民地“天使”并使其崩毁，这死伤惨重的悲剧日后被称为“天使的日落”，之后UE对居住在地球圈的人们带来长期的危害。 A.G.108年 与UE的战斗持续着，原本和平的宇宙殖民地“奥凡”也遭到袭击，居住在此的7岁少年弗里特·明日野在战火中失去了母亲。不过，母亲在临终时，将家中代代相传的记忆单元“AGE装置”托付给他。其中包含着被称为救世主的古代MS“高达”的设计图，弗利特继承了母亲的意志，决心造出高达。 A.G.115年 14岁的弗利特被宇宙殖民地“诺拉”的联邦军基地阿林斯顿接收。七年间，和基地的工程师们持续着研究，终于完成了高达。这部搭载了“AGE系统”的高达，能够令机体自我进化。 然而，可怕的时刻终于来临…… UE的魔爪终于逼近和平的殖民地“诺拉”。 如今，弗利特开动自己制造的高达，挺身而战。 到底弗利特能战胜14年间都不能战胜的可怕敌人UE吗？ 历经明日野家族3代人的“百年战争”由此展开……
藏原走（大冢刚央 配音）是一名性格非常内向的大学一年级男生，不善言辞的他总是习惯用跑步来抒发内心里的情感波动。一天深夜，正在跑步的阿走遇见了名叫清濑灰二（丰永利行 配音）的男子，这个散发着独特魅力的男人主动向阿走搭话，并且向阿走介绍了他所居住的名为竹青庄的公寓。 就这样，阿走在半推半就之下成为了竹青庄的第10名住户。虽然日常打打闹闹但相互非常信赖的城太郎兄弟、被称之为神童，但阿走却觉得他有些古怪的杉山高志（内山昂辉 配音）、热衷于看电视猜谜节目的坂口洋平（北泽力 配音）、性格轻浮却异常讨厌烟味的高材生岩仓雪彦（兴津和幸 配音），和阿走共享着这幢破旧的公寓的，是这些性格稀奇古怪的人们。
主角罗那（兰/拿）是一个平凡的月之子（月之居民）。为贯彻月之女王迪安娜的回归地球行动而与另外两个同伴一同被送到地球。因不适应新环境而几乎遇险，被姬艾尔/苏菲亚姐妹所救而为她们家打工。在一次偶然的机会下发现了埋在矿山中的Turn A Gundam并凭借月之子的经验/判断力而驾驶其对抗入侵的月之回归军。动画并没有特意便标榜罗那为New Type。剧中一些细节，例如罗那变装美女“罗伦”，用高达运牛，洗衣服等等都为这部高达增添了一份前所未有的轻松感． 罗兰肩负月之住民的期望，他是为了用自己的肉体证明月之住民适合地球的环境而被送来的少年中的一人。这是月之住民为回到地球而进行的战斗的第一步，可说是一种献身的行为，罗兰顺利地完成了任务，少年们自从落到地球后，适应了地球的环境并溶入了这里的社会……他们相信，当月球的同伙们访问地球的时候，无论是月之住民还是地球人都可以拉起手来成为朋友。 但是现实无情地打碎了少年们的理想。地球人与月之住民各自的道路是不同的，要让两支小流合成一条大河，也许冲突将不可避免。乘上MS的罗兰，虽是月球人，但却成为地球上最强的战斗力。面对最崇拜的月之女王还有在他身上寄予厚望的一帮地球朋友他将怎么样选择自己的命运？？面对苏菲雅和迪亚娜女王（甚至是高安少爷）的爱他又该何去何从？？面对最终劲敌金卡拉姆的Turn X他又将如何应付？？
