因战争连年，地球环境遭到破坏以致频临灭亡，人类被迫离开地球，五百年来一直生活在巨大太空船内的城市中；主控城市的电脑系统为免人类重蹈覆辙，特意隐瞒实情，让人类生活在虚拟二十世纪的社会中。飙车族矢作省吾从不关心社会及世界事物；他与同伴每天都在玩乐及飙车。直至有一天，他的一位旧朋友把一部神秘的超级电单车留了给他。这部名叫格兰度的超级电单车原来隐藏着一个重大的秘密。利用这部电单车，省吾发现了人类原来一直生活在巨大的太空船内，由一部名叫巴哈姆的超级电脑系统操控着…
继53年之后的DCⅡ的故事顺利落下了帷幕之后，如今时间轴再一次回到了最初代的时间之前。芳乃樱是一位元气活泼的小学三年级女生，每天和好友朝仓纯一与白河小鸟一起到风见学园上学，不过在她的身上却有着大家不为人知的秘密……
美月（桥本千波 配音）和夕哉（间岛淳司 配音）虽然身为兄妹，却并没有血缘关系，父母的重新结合让两人住到了同一屋檐下。个性有些傲娇的美月对夕哉这个突如其来的“哥哥”态度十分冷淡，但随着时间的推移，美月发现了夕哉善良的一面。 一位名叫寿日和（小仓唯 配音）的幽灵少女出现在了美月的身边，寿日和告诉美月，自己死于一场交通事故并且丧失了记忆，脑海中唯一能够记得的就是自己非常非常的喜欢夕哉。寿日和附身在了美月的身上，希望能够借助美月的身体帮助自己了却夙愿归天成佛，然而，对于被附身之后态度变得十分奇怪的美月，夕哉究竟抱有着怎样的感情呢？
很久以前，在宇宙中被粉碎的恶魔碎片，如今仍然祸乱着整个宇宙。 一名不知其真面目的恶徒正借着这些恶魔碎片危害四方，并将其魔爪伸向了光之国。 赛罗奥特曼和他的徒弟泽塔奥特曼勇敢地站了出来，正面迎击敌人。 经过一番激战，泽塔奥特曼独自一人追着怪兽前往地球。 在地球上，人们为了对抗日常出现的怪兽组成了防卫军——怪兽应对机甲部队“军械库（storage）”。在这支部队中有一位热血青年——夏川春树。 宇宙怪兽到达地球的那一刻，泽塔奥特曼和春树相遇了。自此两位热血青年的战斗故事开始了 。
随着恶魔觉醒，人类世界陷入混乱。性格温柔的男孩与恶魔合体，在神秘好友飞鸟了的指引下，卷入一场残酷、堕落的对抗邪恶之战。
