由于父亲欠下了一屁股债人间蒸发，无家可归的女儿桃园奈奈生（三森铃子 配音）只得流浪街头。在这途中，奈奈生帮助了一位被恶狗追逐的男子，男子告诉奈奈生自己名叫御影（石田彰 配音），而在得知了奈奈生的遭遇后，他意外的提出将自己的住处让给奈奈生。一间荒芜的神社——这便是御影所说 的住处，奈奈生自觉上当，却也没有别的地方好去。更令她吃惊的是，御影竟然是神社的土地神，而如今，土地神的头衔，自然也随着住处转嫁到了奈奈生的头上。 莫名其妙的成为了土地神，而身边又出现了称她为“主人”的神使巴卫（立花慎之介 配音），奈奈生还未搞清楚状况，各路个性可爱又调皮的神灵就接二连三的降临到了她的身边。
某个工业地带陆陆续续出现怪兽？！弦人队长率领SKaRD进行迎击，打倒了接二连三的怪兽。SKaRD认为此事与该地带在进行怪兽残骸处理和研究的先进化学企业「尼克罗玛斯公司」有某种关系，SKaRD便急行前往该公司的最高运营者、同时也是世界屈指可数的化学研究者的马布塞博士那里进行调查。 尼克罗玛斯公司的研究所正在开发能够实现与生命根源相关的长生不老物质「达姆特辛」，据说即将完成。在这样的情况下，突然出现了自称「宇宙霸者」的神秘宇宙人「达姆诺星人」！并且，从被破坏的容器中泄露出来的达姆特辛物质吞噬了研究所的怪兽样本，诞生了可怕的巨大怪兽——妖骸魔兽贡吉尔冈。现在，以日本的首都为舞台，布莱泽奥特曼以及SKaRD与大怪兽壮烈的大碰撞帷幕即将拉开！
